Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms