Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYTL3Q4VX76 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms