Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms