Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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