Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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