Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms