Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP7Q16576 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.4 ms