Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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E2F4Q16254 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2F4Q16254 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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