Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN9AQ15858 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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