Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms