Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
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PUM3Q15397 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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