Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
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