Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
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CHD4Q14839 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
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CHD4Q14839 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
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CHD4Q14839 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CHD4Q14839 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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CHD4Q14839 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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CHD4Q14839 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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CHD4Q14839 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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CHD4Q14839 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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