Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARF1Q14162 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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