Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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