Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms