Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEUROD1Q13562 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms