Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms