Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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