Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP4Q13115 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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