Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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CHAF1BQ13112 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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CHAF1BQ13112 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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CHAF1BQ13112 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHAF1BQ13112 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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