Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM32Q13049 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms