Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BNIP1Q12981 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BNIP1Q12981 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BNIP1Q12981 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BNIP1Q12981 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BNIP1Q12981 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BNIP1Q12981 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BNIP1Q12981 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BNIP1Q12981 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BNIP1Q12981 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms