Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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