Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TGM3Q08188 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms