Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LTBQ06643 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LTBQ06643 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LTBQ06643 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LTBQ06643 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LTBQ06643 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LTBQ06643 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LTBQ06643 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LTBQ06643 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LTBQ06643 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LTBQ06643 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LTBQ06643 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LTBQ06643 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LTBQ06643 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LTBQ06643 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LTBQ06643 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LTBQ06643 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LTBQ06643 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LTBQ06643 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LTBQ06643 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LTBQ06643 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LTBQ06643 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LTBQ06643 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LTBQ06643 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
LTBQ06643 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LTBQ06643 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LTBQ06643 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LTBQ06643 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LTBQ06643 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LTBQ06643 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LTBQ06643 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LTBQ06643 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LTBQ06643 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LTBQ06643 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
LTBQ06643 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
LTBQ06643 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LTBQ06643 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LTBQ06643 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
LTBQ06643 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LTBQ06643 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LTBQ06643 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LTBQ06643 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LTBQ06643 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LTBQ06643 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LTBQ06643 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LTBQ06643 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LTBQ06643 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
LTBQ06643 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LTBQ06643 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LTBQ06643 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LTBQ06643 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LTBQ06643 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
LTBQ06643 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LTBQ06643 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
LTBQ06643 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LTBQ06643 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LTBQ06643 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LTBQ06643 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LTBQ06643 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LTBQ06643 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LTBQ06643 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LTBQ06643 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LTBQ06643 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LTBQ06643 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
LTBQ06643 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
LTBQ06643 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms