Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CALD1Q05682 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms