Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms