Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms