Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms