Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLTCQ00610 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms