Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms