Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL8P80075 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL8P80075 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL8P80075 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL8P80075 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL8P80075 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL8P80075 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL8P80075 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL8P80075 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL8P80075 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL8P80075 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL8P80075 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL8P80075 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL8P80075 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL8P80075 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL8P80075 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL8P80075 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL8P80075 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL8P80075 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL8P80075 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL8P80075 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL8P80075 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL8P80075 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL8P80075 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL8P80075 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL8P80075 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL8P80075 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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CCL8P80075 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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CCL8P80075 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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CCL8P80075 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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CCL8P80075 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL8P80075 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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CCL8P80075 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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CCL8P80075 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL8P80075 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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CCL8P80075 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL8P80075 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL8P80075 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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CCL8P80075 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCL8P80075 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCL8P80075 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCL8P80075 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CCL8P80075 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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