Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVFRD-1P60508 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVFRD-1P60508 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms