Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms