Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEMP55040 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEMP55040 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GEMP55040 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GEMP55040 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GEMP55040 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GEMP55040 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GEMP55040 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GEMP55040 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GEMP55040 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GEMP55040 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GEMP55040 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GEMP55040 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GEMP55040 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GEMP55040 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GEMP55040 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GEMP55040 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GEMP55040 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GEMP55040 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GEMP55040 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms