Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB3P54753 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms