Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms