Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MMP13P45452 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MMP13P45452 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MMP13P45452 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MMP13P45452 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MMP13P45452 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MMP13P45452 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MMP13P45452 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP13P45452 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP13P45452 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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