Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBX2P40425 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PBX2P40425 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PBX2P40425 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PBX2P40425 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PBX2P40425 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PBX2P40425 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PBX2P40425 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PBX2P40425 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PBX2P40425 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 AC007919.2-201ENST00000444110 511 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBX2P40425 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms