Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms