Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRMP28827 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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