Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCAP28676 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GCAP28676 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCAP28676 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GCAP28676 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GCAP28676 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GCAP28676 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GCAP28676 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GCAP28676 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GCAP28676 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms