Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 LINC00052-201ENST00000560153 1966 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VAMP1P23763 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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