Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USF1P22415 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USF1P22415 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF1P22415 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF1P22415 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF1P22415 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF1P22415 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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