Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 AL137796.1-201ENST00000608190 577 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 AL807752.1-201ENST00000395082 1322 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 C1QTNF9B-201ENST00000382137 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 AC104116.1-201ENST00000504539 411 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 ZNF93-205ENST00000591366 590 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 AC109635.4-201ENST00000636653 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXB1P14653 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB1P14653 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms