Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCF2P10911 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCF2P10911 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCF2P10911 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCF2P10911 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCF2P10911 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCF2P10911 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCF2P10911 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCF2P10911 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCF2P10911 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCF2P10911 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCF2P10911 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCF2P10911 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MCF2P10911 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCF2P10911 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCF2P10911 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCF2P10911 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCF2P10911 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCF2P10911 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCF2P10911 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCF2P10911 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCF2P10911 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCF2P10911 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms