Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COCHO43405 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
COCHO43405 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
COCHO43405 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
COCHO43405 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
COCHO43405 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
COCHO43405 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
COCHO43405 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
COCHO43405 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COCHO43405 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COCHO43405 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COCHO43405 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COCHO43405 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COCHO43405 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COCHO43405 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COCHO43405 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COCHO43405 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COCHO43405 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms