Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSI1O43347 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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MSI1O43347 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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MSI1O43347 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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MSI1O43347 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSI1O43347 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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MSI1O43347 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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MSI1O43347 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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MSI1O43347 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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MSI1O43347 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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MSI1O43347 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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