Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms